Elas estão na cidade de Taketa, a uns 150 km de Nagasaki, e só foram descobertas em 2011. Trata-se de oito pequenas covas escavadas na rocha vulcânica, onde os cristãos se reuniam para rezar durante as perseguições dos séculos XVI e XVII. 
Situada numa região de grande beleza natural, Taketa era, no início da evangelização do país, um dos locais com maior número de católicos. As estimativas são de que nos bosques das montanhas possam existir pelo menos uma centena de capelas.